Les évaluations d’un cours d’eau et évaluations de reconnaissance sont généralement effectuées pour obtenir une vue d’ensemble de l’état de l’habitat du poisson. Parmi les paramètres généralement mesurés, on retrouve l’hydrochimie de base (température, pH, alcalinité, le calcium et le phosphore), la température de l’eau et de l’air, l’oxygène, le débit d’eau, la sédimentation et les observations générales physiques (le type d’habitat, les substrats, l’envasement, la largeur, l’ombre, la végétation, la stabilisation des berges).